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二次解析ソリューション
AWS for Genomics を使ってオンデマンドでスケーリングできるクラス最高のツールを利用して、ゲノムデータの分析を合理化および加速します。
AWS HealthOmics Ready2Run ワークフロー
ゲノムおよび生物学的データをインサイトに変換する
二次解析の自動化と高速化
ゲノミクス研究組織がワークフローを最適化し、分析時間を短縮できるように、AWS for Genomics は、さまざまな AWS および AWS パートナーのワークフローオートメーションおよび二次解析ソリューションを提供しています。 AWS HealthOmics などのマネージドサービスでは、フルマネージド型のバイオインフォマティクスコンピューティングを提供します。
ワークフローオートメーション
ゲノミクスワークフローを実行するには、手動でのプロビジョニングと設定が必要です。AWS、AWS パートナー、およびオープンソースコミュニティのワークフローオートメーションおよびオーケストレーションツールは、研究を加速し、コンピューティング能力をスケールするのに役立ちます。 AWS HealthOmics などのマネージドサービスは、バイオインフォマティクス計算を完全に管理します。データ、ツール、ワークフローの定義を持ち込めば、あとは数回クリックするだけでゲノミクス分析を実行することができます。ソリューションライブラリに移動。
AWS ソリューション
主なパートナーのソリューション
DNAnexus
「診断薬やバイオ製薬のトップ企業は、データ集約型の反復作業を自動化し、スピードと正確性を高めるために AWS 上の DNAnexus を活用しています。その結果、これらの企業は、研究開発を劇的に削減し、パイプラインの開発を数週間から数時間に短縮することができました」
詳細Seqera Labs
「Seqera Labs と AWS は、AWS がライフサイエンスのワークロードに最適な環境であるようにするために協力してきました。Nextflow と Nextflow Tower は、エラスティックコンピューティングのための AWS Batch、シームレスなデプロイのための EKS、コスト効率とパフォーマンスに優れたデータストレージのための AWS ファイルとオブジェクトストレージサービスにシームレスに統合されています」
詳細
Seven Bridges
「Seven Bridges プラットフォームと GRAF™ や ARIA™ などの Seven Bridges 分析ツールは、AWS の柔軟性と拡張性を利用しており、研究者がゲノムや表現型の膨大なデータのリポジトリを活用することを可能にしています。これにより、疾患の根底にあるもの、新しい治療法、試験管内疾患モデルに関する革新的なインサイトを見出せる可能性があります」
詳細
AWS Marketplace
Illumina の DRAGEN Bio-IT プラットフォームは、全ゲノム、エクソーム、遺伝子/パネルなどの大規模データセットの次世代シーケンス (NGS) データの超高速分析を可能にします。分析内容には、マッピング、整列、並べ替え、重複マーキング、小さなバリアントの呼び出しなどが含まれます。
二次解析
ゲノミクスの採用が加速し続ける中、制約として二次解析がしばしば挙げられます。分析を加速し、需要の増加に対応するために、ゲノミクス組織は AWS のスケーラビリティとコスト効率を活用しています。
主なお客様
Illumina
Illumina の DRAGEN Bio-IT プラットフォームは、正確で超高速な二次解析結果を提供します。お客様は Amazon EC2 F1 インスタンスで DRAGEN を実行することで、分析を強化し、劇的に加速することができます。 動画を見る
Munich Leukemia Lab (MLL)
Munich Leukemia Lab は AWS を使用することで、患者のゲノムデータを処理するまでの所要時間を 20 時間から 3 時間に短縮し、研究を加速し、白血病の診断を改善できるようになりました。 導入事例を読む
Ancestry
Ancestry は、Amazon EFS を利用して、複数の科学者がゲノミクス研究を実行し、コンピューティングとストレージをスケールアップまたはスケールダウンし、科学者をより迅速にオンボーディングできるようにします。 導入事例を読む
主なパートナーのソリューション
Illumina
「ヒトゲノムの力を引き出すためには、正確さと速さが不可欠です。Illumina の DRAGEN Bio-IT プラットフォームは、正確で超高速な二次解析結果を提供します。お客様は、AWS 上で実行される DRAGEN を使用して、分析を強化し、劇的に加速することができます」 詳細
NVIDIA
「NVIDIA Clara Parabricks Pipelines は、GPU で加速したコンピューティングフレームワークで、DNA から RNA までのゲノムアプリケーションをサポートします。Parabricks の高速性と AWS のスケーラビリティを組み合わせることで、ゲノミクス業界はプロジェクトをより速く、よりコスト効率よく実行できるようになり、研究者はデータの中からより多くの遺伝的変異を特定できるようになります」 詳細
Seven Bridges
「Seven Bridges プラットフォームと GRAF™ や ARIA™ などの Seven Bridges 分析ツールは、AWS の柔軟性と拡張性を利用しており、研究者がゲノムや表現型の膨大なデータのリポジトリを活用することを可能にしています。これにより、疾患の根底にあるもの、新しい治療法、試験管内疾患モデルに関する革新的なインサイトを見出せる可能性があります」 詳細
Lifebit
主なコンサルティングパートナー
BioTeam
AWS Marketplace
主なリソース
二次分析計算コストの最適化
Amazon Elastic Compute Cloud (EC2)、スポットインスタンス、AWS Batch を使用して二次分析のコンピューティングコストを最適化する方法を学びましょう。ホワイトペーパーを読む