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Soluzioni per le analisi secondarie
Semplifica e accelera l'analisi dei dati genomici con l'accesso ai migliori strumenti disponibili per la scalabilità on demand con AWS for Genomics.
Flussi di lavoro Ready2Run di AWS HealthOmics
Trasforma i dati genomici e biologici in informazioni dettagliate
Automatizza e accelera l'analisi secondaria
Per aiutare le organizzazioni di genomica a ottimizzare i flussi di lavoro e ridurre i tempi di analisi, AWS per la genomica offre una vasta gamma di soluzioni e servizi di automazione dei flussi di lavoro e analisi secondarie di AWS e dei partner AWS. Servizi gestiti come AWS HealthOmics forniscono calcoli di bioinformatica completamente gestiti.
Automazione dei flussi di lavoro
L'esecuzione di flussi di lavoro genomici richiede provisioning e configurazioni manuali. Gli strumenti di orchestrazione e automazione del flusso di lavoro di AWS, dei partner AWS e della comunità open source possono aiutare ad accelerare la ricerca e a dimensionare le capacità di elaborazione. Servizi gestiti come AWS HealthOmics forniscono calcoli di bioinformatica completamente gestiti: dopo avere raccolto dati, strumenti e definizioni del flusso di lavoro, potai eseguire le analisi genomiche in pochi clic. Vai alla Libreria delle soluzioni .
Soluzioni AWS
Clienti in evidenza
Fred Hutchinson Cancer Research Center
Grazie ad AWS, la Fred Hutch Microbiome Research Initiative ha ridotto il suo tempo di elaborazione da 7 anni a 7 giorni. Leggi il caso di studio
Gritstone Oncology
Gritstone Oncology utilizza AWS e una coda di lavoro condivisa basata su Nextflow per inviare processi e gestire il flusso di dati. Leggi il caso di studio
Helix
Helix utilizza BaseSpace Sequence Hub, una piattaforma di analisi dei dati genomici di Illumina, per migliorare il suo lavoro. Guarda il video
Soluzioni dei partner in evidenza
DNAnexus
"Top diagnostics and biopharma companies leverage DNAnexus on AWS to automate recurrent data intensive tasks for speed and accuracy. Di conseguenza, queste aziende ottengono una drastica riduzione della loro ricerca e sviluppo, accelerando lo sviluppo della pipeline da settimane a ore".
Ulteriori informazioniSeqera Labs
"Seqera Labs e AWS hanno collaborato per essere certi che AWS fosse l'ambiente preferito per i carichi di lavoro del settore sanitario. Nextflow e Nextflow Tower sono perfettamente integrati in Batch AWS per un calcolo elastico, EKS per un'implementazione senza interruzioni e servizi di archiviazione di file e oggetti AWS per un'archiviazione dei dati conveniente e performante".
Ulteriori informazioni
Seven Bridges
"La piattaforma Seven Bridges e gli strumenti di analisi Seven Bridges come GRAF™ e ARIA™ si basano sulla flessibilità e la scalabilità di AWS per consentire ai ricercatori di trarre vantaggio da archivi di dati genomici e fenotipici di dimensioni enormi che hanno il potenziale per rivelare approfondimenti trasformativi dei fattori scatenanti della malattia, nuovi approcci terapeutici e modelli di malattia in silico".
Ulteriori informazioni
Partner di consulenza in evidenza
AWS Marketplace
La piattaforma DRAGEN Bio-IT di Illumina consente un'analisi ultrarapida dei dati di Next Generation Sequencing (NGS) per set di dati di grandi dimensioni, come interi genomi, esomi e geni/panel. L'analisi include la mappatura, l'allineamento, l'ordinamento, la marcatura dei duplicati, l'identificazione di piccole varianti e altro ancora.
Analisi secondaria
Poiché l'adozione della genomica continua ad accelerare, l'analisi secondaria viene spesso citata come un vincolo. Per accelerare l'analisi e tenere il passo con l'aumento della domanda, le organizzazioni di genomica sfruttano la scalabilità e l'efficienza dei costi di AWS.
Soluzioni AWS
Clienti in evidenza
Illumina
La piattaforma DRAGEN Bio-IT di Illumina fornisce un'analisi secondaria accurata e ultra rapida. I clienti possono potenziare e accelerare notevolmente le proprie analisi con DRAGEN in esecuzione su istanze Amazon EC2 F1. Guarda il video
Munich Leukemia Lab (MLL)
Con AWS, il Munich Leukemia Lab riduce i tempi di elaborazione dei dati genomici dei pazienti da 20 a 3 ore, contribuendo ad accelerare la ricerca e a migliorare la diagnosi di leucemia. Leggi il caso di studio
Ancestry
Ancestry si affida ad Amazon EFS per consentire a più scienziati di eseguire ricerche genomiche, aumentare o diminuire il calcolo e lo storage e integrare gli scienziati più rapidamente. Leggi il caso di studio
Soluzioni dei partner in evidenza
Illumina
"La precisione e la velocità sono essenziali per mappare il genoma umano. La piattaforma DRAGEN Bio-IT di Illumina fornisce un'analisi secondaria accurata e ultra rapida. I clienti possono potenziare e accelerare notevolmente le loro analisi con DRAGEN in esecuzione su AWS". Ulteriori informazioni
NVIDIA
"NVIDIA Clara Parabricks Pipelines è un framework di calcolo accelerato da GPU, che supporta applicazioni genomiche che vanno dal DNA all'RNA. L'accelerazione di Parabricks, unita alla scalabilità di AWS, sta spingendo l'industria della genomica a realizzare progetti più velocemente, in modo più conveniente e consentendo ai ricercatori di identificare più varianti genetiche nei loro dati". Ulteriori informazioni
Seven Bridges
"La piattaforma Seven Bridges e gli strumenti di analisi Seven Bridges come GRAF™ e ARIA™ si basano sulla flessibilità e la scalabilità di AWS per consentire ai ricercatori di trarre vantaggio da archivi di dati genomici e fenotipici di dimensioni enormi che hanno il potenziale per rivelare approfondimenti trasformativi dei fattori scatenanti della malattia, nuovi approcci terapeutici e modelli di malattia in silico". Ulteriori informazioni
Lifebit
Partner di consulenza in evidenza
BioTeam
AWS Marketplace
Risorsa in evidenza
Ottimizzazione dei costi di elaborazione dell'analisi secondaria
Scopri come ottimizzare i costi di elaborazione dell'analisi secondaria utilizzando Amazon Elastic Compute Cloud (EC2), istanze spot e AWS Batch. Leggi il whitepaper