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Solutions d'analyse secondaire
Simplifiez et accélérez l'analyse des données génomiques en accédant aux meilleurs outils disponibles à la demande avec AWS for Genomics.
Flux de travail AWS HealthOmics Ready2Run
Transformer les données génomiques et biologiques en informations
Automatiser et accélérer l'analyse secondaire
Pour aider les organisations de génomique à optimiser les flux de travail et à accélérer l'analyse, AWS pour la génomique offre divers services et solutions d'automatisation des flux de travail et d'analyse secondaire AWS et des partenaires AWS. Les services gérés, comme AWS HealthOmics, fournissent un calcul bioinformatique entièrement géré.
Automatisation des flux de travail
L'exécution de flux de travail génomiques nécessite un provisionnement et des configurations manuels. Les outils d'automatisation et d'orchestration des flux de travail d'AWS, des partenaires AWS et de la communauté open-source permettent d'accélérer la recherche et de mettre à l'échelle les fonctionnalités de calcul. Les services gérés, comme AWS HealthOmics, fournissent un calcul bioinformatique entièrement géré. Il vous suffit d'apporter vos données, vos outils et la définition du flux de travail, puis d'exécuter vos analyses génomiques en quelques clics. Accédez à la bibliothèque de solutions .
Solutions AWS
Clients en vedette
Fred Hutchinson Cancer Research Center
Grâce à AWS, Fred Hutch Microbiome Research réduit le temps de calcul de 7 ans à 7 jours. Lire l'étude de cas
Gritstone Oncology
Gritstone Oncology utilise AWS et une file d'attente partagée Nextflow pour répartir les tâches et gérer le flux de données. Lire l'étude de cas
Helix
Helix utilise BaseSpace Sequence Hub, une plateforme d'analyse des données génomiques d'Illumina, pour optimiser son travail. Regarder la vidéo
Solutions de partenaires en vedette
DNAnexus
« Les meilleures entreprises de diagnostic et de biopharmacie s'appuient sur DNAnexus sur AWS pour automatiser les tâches récurrentes à utilisation massive de données, afin de gagner en rapidité et en précision. Par conséquent, ces entreprises parviennent à réduire considérablement leurs activités de R&D, en faisant passer le développement de leur pipeline de plusieurs semaines à quelques heures. »
En savoir plusSeqera Labs
« Seqera Labs et AWS collaborent pour qu'AWS soit l'environnement de choix pour les charges de travail des sciences de la vie. Nextflow et Nextflow Tower sont intégrés de manière transparente à AWS Batch pour le calcul Elastic, à EKS pour un déploiement transparent et aux services de stockage de fichiers et d'objets d'AWS pour bénéficier d'un stockage de données rentable et performant. »
En savoir plus
Seven Bridges
« La plateforme Seven Bridges et les outils d'analyse Seven Bridges tels que GRAF™ et ARIA™ s'appuient sur la flexibilité et la capacité de mise à l'échelle d'AWS pour permettre aux chercheurs de tirer parti de référentiels massifs de données génomiques et phénotypiques. Ces référentiels ont le potentiel de révéler des informations transformatrices sur les causes des maladies, de nouvelles approches thérapeutiques et des modèles de maladies in silico. »
En savoir plus
Partenaires consultants en vedette
AWS Marketplace
La plateforme DRAGEN Bio-IT d'Illumina permet d'analyser excessivement rapidement les données de séquençage de nouvelle génération (NGS) pour les grands jeux de données, tels que les génomes entiers, les exomes et les gènes/panels. L'analyse comprend le mappage, l'alignement, le tri, le marquage des doublons, l'appel de petites variantes et plus encore.
Analyse secondaire
Alors que l'adoption de la génomique continue de s'accélérer, l'analyse secondaire est souvent citée comme une contrainte. Pour accélérer les analyses et répondre à la demande croissante, les organisations de génomique tirent parti de l'évolutivité et de la rentabilité d'AWS.
Solutions AWS
Clients en vedette
Illumina
La plateforme DRAGEN Bio-IT d'Illumina fournit des résultats d'analyse secondaire précis et ultra rapides. Les clients peuvent optimiser et accélérer considérablement leurs analyses grâce à DRAGEN qui s'exécute sur des instances Amazon EC2 F1. Regarder la vidéo
Munich Leukemia Lab (MLL)
Grâce à AWS, le laboratoire de leucémie de Munich réduit le délai de traitement des données génomiques des patients de 20 heures à 3 heures, ce qui permet d'accélérer la recherche et d'améliorer le diagnostic de la leucémie. Lire l'étude de cas
Ancestry
Ancestry s'appuie sur Amazon EFS pour permettre à plusieurs scientifiques d'effectuer des recherches en génomique, d'augmenter ou de réduire les capacités de calcul et de stockage et d'intégrer plus rapidement des scientifiques. Lire l'étude de cas
Solutions de partenaires en vedette
Illumina
« La précision et la rapidité sont essentielles pour libérer la puissance du génome humain. La plateforme DRAGEN Bio-IT d'Illumina fournit des résultats d'analyse secondaire précis et ultrarapides. Les clients peuvent optimiser et accélérer considérablement leurs analyses avec DRAGEN exécuté sur AWS. » En savoir plus
NVIDIA
« NVIDIA Clara Parabricks Pipelines est un cadre de calcul accéléré par GPU, qui prend en charge les applications génomiques qui vont de l'ADN à l'ARN. L'accélération de Parabricks combinée à la capacité de mise à l'échelle d'AWS permet au secteur de la génomique de réaliser des projets plus rapidement et à moindre coût, et aux chercheurs d'identifier davantage de variantes génétiques dans leurs données. » En savoir plus
Seven Bridges
« La plateforme Seven Bridges et les outils d'analyse Seven Bridges tels que GRAF™ et ARIA™ s'appuient sur la flexibilité et la capacité de mise à l'échelle d'AWS pour permettre aux chercheurs de tirer parti de référentiels massifs de données génomiques et phénotypiques. Ces référentiels ont le potentiel de révéler des informations transformatrices sur les causes des maladies, de nouvelles approches thérapeutiques et des modèles de maladies in silico. » En savoir plus
Lifebit
Partenaires consultants en vedette
BioTeam
AWS Marketplace
Ressources présentées
Optimisation des coûts de calcul de l'analyse secondaire
Découvrez comment optimiser les coûts de calcul des analyses secondaires à l'aide d'Amazon Elastic Compute Cloud (EC2), des instances ponctuelles et d'AWS Batch. Lire le livre blanc